Người Turk Sakha (người Yakut) đến này vào khoảng thời gian khá gần đây là thế kỷ 13 từ khu vực Trung Á. Họ có nguồn gốc hỗn hợp Turk (Đột Quyết) và Mông Cổ. Họ đã tiến hành chinh phục các bộ lạc Altai săn bắn-hái lượm bản địa và bắt đầu tự gọi mình là "Sakha", nguồn gốc của từ này chưa rõ ràng và có nhiều tranh luận.

Người Evenk gọi người Sakha là "Yako" và thuật ngữ này được người Nga sử dụng khi họ đến khu vực vào thế kỷ thứ 17. Tygyn, một vị vua của người Yakut Khangalassky, đã chấp thuận việc người Nga định cư để đổi lấy hiệp ước quân sự mà trong đó bao gồm cả chiến tranh chống lại các cuộc nổi loạn của người bản địa tại toàn bộ vùng phía Đông của Bắc Á (Magadan, Chukotka, Kamchatka và Sakhalin). Vua của người Yakut Megino-Khangalassky, Kull bắt đầu một âm mưu bằng cách cho xây dựng các hàng rào phòng thủ đầu tiên. Vào tháng 8 năm 1638, triều đình ở Moskva cho thành lập một đơn vị hành chính mới với trọng tâm là Lensky Ostrog.

Có nhiều điều bí ẩn về việc di cư đến và nguồn gốc của những người định cư Nga tại Russkoye Ustye, là nơi cực kỳ biệt lập tại đồng bằng Indigirka, họ được biết đến với nét văn hóa cổ xưa. Hầu hết các sử gia nghiên cứu rằng họ đến nơi này vào một khoảng thời gian nào đó trong thế kỷ 17[13]

Người Nga hình thành nên một nền nông nghiệp tại lưu vực sông Lena. Các thành viên của các nhóm tôn giáo bị lưu đày đến Sakha vào nửa sau thế kỷ 19 bắt đầu trồng lúa mì, yến mạch và khoai tây. Buôn bán lông thú hình thành một nền kinh tế dùng tiền mặt. Công nghiệp và giao thông bắt đầu phát triển vào cuối thế kỷ 19 và khi bắt đầu thời kỳ Xô viết. Ngoài ra, người ta cũng bắt đầu các hoạt động thăm dò địa chất, khai mỏ và sản xuất chì tại địa phương. Những chiếc tàu và xà lan sử dụng đầu máy hơi nước cũng được đưa đến.

Vào ngày 27 tháng 4 năm 1922, vùng đất Yskytskaya được tuyên bố trở thành Cộng hòa Xã hội chủ nghĩa Xô viết Tự trị Yakut, tuy vậy trên thực tế vùng phía đông của nó, bao gồm cả thành phố Yakutsk, do phe Bạch vệ kiểm soát. Năm 1992, sau khi Liên Xô tan rã, Yakutia được công nhận là Cộng hòa Sakha (Yakutia) thuộc phạm vi Liên bang Nga.

Yakutia là vùng xa xôi cách trở, ngay cả khi so sánh với phần còn lại của Siberi, vì vậy nơi đây đã được triều đình Sa hoàng và chính quyền cộng sản lựa chọn để lưu đày tù nhân. Những người bị lưu đày nổi tiếng nhất thời Sa hoàng là nhà văn dân chủ Nikolai Chernyshevsky, người từ chối nhập ngũ Doukhobor, nhà cách mạng xã hội và nhà văn Vladimir Zenzinov, ông đã để lại các mô tả đáng chú ý về những từng trải của mình tại vùng Bắc Cực.